Publié le 21 octobre 2026 · Publication originale
Trente, Italie.
Le 21 janvier 2026, Liviana Ricci, Vitor Heidrich, Michal Punčochář et leurs collègues publient dans Nature une enquête sur 134 personnes liées à trois crèches, dont 43 bébés entrant en collectivité vers dix mois.
Ils analysent 1.013 échantillons de selles et comparent les bactéries au niveau des souches, pas seulement des espèces.
Après un mois, les enfants d'une même classe partagent déjà significativement plus de souches entre eux que des enfants de crèches différentes.
Après trois mois, les souches acquises à la crèche représentent une part du microbiote comparable, puis supérieure, à celle attribuée à la famille.
Le microbiote intestinal ne se construit donc pas uniquement verticalement, des parents vers l'enfant.
Il circule aussi horizontalement entre bébés.
Les chercheurs reconstituent même un trajet particulièrement frappant.
Une souche d'Akkermansia muciniphila apparaît chez un bébé, puis chez un camarade de crèche. Elle est ensuite retrouvée chez la mère et le père de ce dernier. Chez le père, elle remplace une souche différente de la même espèce.
Une autre souche, Bifidobacterium pseudocatenulatum, apparaît après l'entrée en crèche puis se retrouve chez huit enfants.
Avoir un frère ou une soeur est associé à une diversité bactérienne initiale plus élevée et à moins d'acquisitions venant des camarades.
ULTRA®
La découverte tient à une distinction invisible à l'oeil nu: espèce et souche ne sont pas la même chose.
Deux personnes peuvent héberger Akkermansia muciniphila tout en possédant des lignées génétiques différentes.
Les chercheurs utilisent une métagénomique résolue au niveau des souches, notamment StrainPhlAn, pour suivre ces lignées dans le temps.
C'est ce niveau de précision qui permet de reconstruire des chaînes plausibles de transmission entre enfants puis vers leur famille.
L'étude montre aussi qu'après antibiothérapie, les bébés conservent moins de leurs souches identifiables et en acquièrent davantage de nouvelles.
Les auteurs n'en déduisent aucun bénéfice sanitaire de la crèche.
Ils montrent quelque chose de plus fondamental: pendant la première année de collectivité, les relations sociales deviennent une force mesurable de construction du microbiote.
Une partie de notre biologie se transmet donc entre individus sans aucun lien généalogique.
DARWIN
Nous héritons de ceux qui nous ont donné naissance, mais aussi de ceux auprès desquels nous avons vécu.
Sources
Ricci, Heidrich, Punčochář et al., Nature, 21 janvier 2026
Nature Research Briefing, 11 février 2026
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