Publié le 30 septembre 2026 à 12:00 · Publication originale
Le 29 septembre 2026, Erick Odoyo, Collins Kigen et leurs collègues publient dans "Scientific Reports" l'analyse de la souche isolée.
Elle résiste aux quatre classes testées.
Fluconazole: CMI ≥64 mg/L.
Micafungine: >8 mg/L.
Amphotéricine B: 2 mg/L.
Flucytosine: ≥64 mg/L.
Les auteurs la présentent comme le deuxième isolat documenté au monde résistant à ces quatre classes, après un cas signalé à New York en 2022.
Le génome montre une partie du mécanisme.
ERG11 Y132F est associée à la résistance aux azolés. FKS1 S639F modifie la cible des échinocandines. Une mutation stop dans FUR1 peut interrompre la voie nécessaire à l'activation intracellulaire de la flucytosine.
Pour l'amphotéricine B, l'explication reste moins claire.
Même après séquençage du génome entier, toute la résistance observée ne se laisse donc pas attribuer à une mutation connue.
C. auris peut aussi coloniser sans provoquer immédiatement d'infection et persister dans l'environnement hospitalier assez longtemps pour atteindre d'autres patients vulnérables.
L'ECDC a recensé 4.012 colonisations ou infections dans l'UE/EEE entre 2013 et 2023. Pour la seule année 2023: 1.346 cas.
Cela ne signifie pas que l'Europe est confrontée à une pan-résistance généralisée.
Le cas kényan montre plus précisément qu'un même isolat peut accumuler assez de mécanismes pour neutraliser quatre grandes familles thérapeutiques.
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La France possède déjà un signal de transmission.
Depuis le premier cas identifié rétrospectivement en 2007, le Centre national de référence de l'Institut Pasteur recense 73 épisodes de colonisation ou d'infection à C. auris, majoritairement importés.
En janvier 2024, un patient rapatrié d'Ukraine introduit dans un hôpital français une souche du clade III. Le séquençage du génome entier relie ensuite plusieurs cas au même cluster. De nouvelles détections surviennent début 2025.
C'est ici que le séquençage change la prévention.
Il peut relier des isolats avant que plusieurs infections graves ne rendent la transmission évidente.
La pan-résistance reste exceptionnelle. Mais C. auris associe diffusion hospitalière et arsenal thérapeutique limité.
Pour certains isolats, il peut ne rester aucun des antifongiques usuels auxquels on s'attendait encore à pouvoir recourir.
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Une médecine sans réserve thérapeutique découvre brutalement la valeur de chaque molécule qu'elle croyait acquise.
Sources
Odoyo et al., Scientific Reports, 29 septembre 2026
Institut Pasteur, CNR Mycoses invasives et antifongiques, 2026
ECDC, surveillance Candidozyma auris
OMS, Fungal Priority Pathogens List
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